使用Picus®電動移液器、Safetyspace低吸附濾芯吸頭和濾芯吸頭。Picus®使用多次分液模式。移取Master Mix時,將電動移液器速度參數(shù)設(shè)置為1。
qPCR準(zhǔn)備
qPCR準(zhǔn)備階段使用Picus®電動移液器、Safetyspace濾芯吸頭及低吸附濾芯吸頭。Lo-Bind EP管用于DNA樣品制備及Master Mix的制備。制備用于所有測試的PCR Master Mix儲備液使用了MaximaSYBR Green qPCR Master Mix(不含ROX)、大腸桿菌uidA基因引物以及無核酸酶水。
用移液器將八個 15μL 的Master Mix重復(fù)樣品移取至PCR板孔中,用于各種測試條件。無模板對照(NTC)樣品不含大腸桿菌基因組DNA,并加入 5μL 無核酸酶水。用類似方法移取 5μL 含有1×106、1×105、1×104、1×103 以及1×102 個拷貝丨反應(yīng)大腸桿菌gDNA的系列稀釋標(biāo)準(zhǔn)品。
在每個測試孔中有 5μL 含有1×103 個拷貝丨反應(yīng)的大腸桿菌gDNA。使用Picus® 電動移液器的多次分液功能及低吸附濾芯吸頭以相同的方式將所有DNA樣本添加到PCR管中。使用LightCycler®480 qPCR儀進行qPCR。循環(huán)參數(shù)如下:在 95°C下預(yù)培養(yǎng) 10 分鐘,隨后在 95°C 10 秒、55°C 10 秒、75°C 15 秒,75°C延伸 10 秒,40 次循環(huán)。
對標(biāo)準(zhǔn)品、對照品和樣品中的SYBR綠色熒光激發(fā)進行定量。使用LightCycler® 480軟件確定定量循環(huán)(Cq)值和實際拷貝數(shù),并使用MS Excel分析結(jié)果。
數(shù)據(jù)分析
Cq值的百分比系統(tǒng)誤差(%S)反映了處理Master Mix的儀器系統(tǒng)(移液器和吸頭系統(tǒng))Cq值的誤差。移液過程中的隨機誤差是結(jié)果精準(zhǔn)度的測量,反映了實驗中重復(fù)樣品之間的差異。Cq值的百分比隨機誤差(%R)反映了結(jié)果的重現(xiàn)性,并且可能受到實驗人員移液操作的影響。
基于PCR原理的實驗中使用電動移液器移取Master Mix可確保高準(zhǔn)確度和精準(zhǔn)度。此外,電動移液器可加快完成實驗的速度,減少移液所需的時間,使操作更符合人體工程學(xué)。因此,使用電動移液器可以降低實驗室工作人員患上重復(fù)性勞損(RSI)的可能性,并使實驗更不容易出錯,它還能在相同的實驗中使用更少的移液器吸頭,因此也是更環(huán)保的選擇。